【導(dǎo)師】宋馳，現(xiàn)任成都中醫(yī)藥大學(xué)特聘教授，2005年本科畢業(yè)于武漢大學(xué)生物技術(shù)專業(yè)，2012年博士畢業(yè)于中國科學(xué)院武漢植物園，2015-2018年在澳門大學(xué)從事博士后研究。擔(dān)任世界中聯(lián)李時珍醫(yī)藥研究與應(yīng)用專業(yè)委員會理事，中華中醫(yī)藥學(xué)會中醫(yī)藥信息學(xué)分會常務(wù)委員，中國中醫(yī)藥信息研究會中醫(yī)藥研究開發(fā)與咨詢專業(yè)委員會委員。曾任中國中醫(yī)科學(xué)院中藥研究所數(shù)據(jù)中心副主任，華大基因研究院植物基因組學(xué)研究團隊科研主管。多年來從事藥用植物資源、基因組及生物信息學(xué)研究，共同發(fā)起“千種藥用植物基因組計劃”和“千種熱帶植物基因組計劃”并建設(shè)本草基因組學(xué)學(xué)科，已成功發(fā)表丹參、菊花、黃連、地黃、紅豆杉、穿心蓮等SCI研究論文三十余篇，包括國際頂級學(xué)術(shù)期刊Nature Genetics（2011，2012a，2012b，2012c），Nature Biotechnology（2013），Nature Communicaiton（2014，2017，2021a，2021b）和 Molecular Plant（2015，2018），文章累計影響因子超過400。主持研究課題六項（含主持一項國家重點研發(fā)項目），獲得發(fā)明專利兩項，軟件著作權(quán)十余項。
個人聯(lián)系方式：songchi@cdutcm.edu.cn
現(xiàn)主要研究方向為：藥用物種基因組及資源鑒定研究，基于高通量測序技術(shù)的大數(shù)據(jù)研究。
代表性論文（影響因子為2023年最新版，IF>=5.0）：
1) The Metasequoia genome and evolutionary relationship among redwoods. Plant Communications, 2023. (IF=10.5)，并列第一作者
2) Genome Assembly of Polygala tenuifolia Provides Insights into Its Karyotype Evolution and Triterpenoid Saponin Biosynthesis. Horticulture Research, 2023. (IF=8.7)，共同作者
3) Assembly and analysis of the mitochondrial genome of Prunella vulgaris. Frontiers in Plant Science, 2023. (IF=5.6)，通訊作者
4) 1K Medicinal Plant Genome Database: An integrated database combining genomes and metabolites of medicinal plants. Horticulture Research, 2022. (IF=8.7)，通訊作者
5) Herbgenomics: Decipher molecular genetics of medicinal plants. The Innovation, 2022. (IF=32.1)，共同作者
6) The Cycas genome and the early evolution of seed plants. Nature Plants, 2022. (IF=18.0)，共同作者
7) Taxus yunnanensis genome offers insights into gymnosperm phylogeny and taxol production. Communications Biology, 2021. (IF=5.9)，第一作者
8) De novo genome assembly of the potent medicinal plant Rehmannia glutinosa using nanopore technology. Computational and Structural Biotechnology Journal, 2021. (IF=6.0)，并列第一作者
9) Analysis of the Coptis chinensis genome reveals the diversification of protoberberine-type alkaloids. Nature Communication, 2021. (IF=16.6)，共同作者
10) The Welwitschia genome reveals a unique biology underpinning extreme longevity in deserts. Nature Communication, 2021. (IF=16.6)，共同作者
11) Genome-wide analyses reveals a glucosyltransferase involved in rutin and emodin glucoside biosynthesis in tartary buckwheat. Food Chemistry, 2020. (IF=8.8)，共同作者
12) The Chrysanthemum nankingense genome provides insights into the evolution and diversification of chrysanthemum flowers and medicinal traits. Molecular Plant, 2018. (IF=27.5)，第一作者
13) The medicinal plant Andrographis paniculata genome provides insight into biosynthesis of the bioactive diterpenoid neoandrographolide. The Plant Journal, 2018. (IF=7.2)，并列通訊作者
14) Rapid radiations of both kiwifruit hybrid lineages and their parents shed light on a two-layer mode of species diversification. New Phytologist, 2017. (IF=9.4)，并列第一作者
15) Genome assembly with in vitro proximity ligation data and whole genome triplication in lettuce. Nature Communication, 2017. (IF=16.6)，共同作者
16) Analysis of the genome sequence of the medicinal plant Salvia miltiorrhiza. Molecular Plant, 2016. (IF=27.5)，共同作者
17) Identification of a novel salt tolerance gene in wild soybean by whole-genome sequencing. Nature Communication, 2014. (IF=16.6)，共同作者
18) A chromosomal genomics approach to assess and validate the desi and kabuli draft chickpea genome assemblies. Plant Biotechnology Journal, 2014. (IF=13.8)，共同作者
19) Genome sequencing of the high oil crop sesame provides insight into oil biosynthesis. Genome Biology, 2014. (IF=12.3)，共同作者
20) Draft genome sequence of chickpea (Cicer arietinum) provides a resource for trait improvement. Nature Biotechnology, 2013. (IF=46.9)，第二作者
21) Maize HapMap2 identifies extant variation from a genome in flux. Nature Genetics, 2012. (IF=30.8)，并列第一作者
22) Comparative population genomics of maize domestication and improvement. Nature Genetics,2012. (IF=30.8)，共同作者
23) The draft genome of a diploid cotton Gossypium raimondii. Nature Genetics, 2012. (IF=30.8)，共同作者
24) The genome of the mesopolyploid crop species Brassica rapa. Nature Genetics, 2011. (IF=30.8)，共同作者