我院開展“研究生學術(shù)交流論壇(九)”
為了加強我院研究生的學術(shù)交流,展示最新研究成果,提高研究生的學術(shù)素養(yǎng),營造濃厚的學術(shù)氛圍,我院開展了每月舉辦一次的“研究生學術(shù)交流論壇”。第九期研究生學術(shù)交流論壇于2022年9月7日晚上7點30分在線上平臺騰訊會議召開,會議由吳心語老師主持,學院教師代表和全體研究生參會。
本次論壇邀請的是我院2020級臨床檢驗診斷學碩士文霄瑕同學為大家分享以“基于血小板測序數(shù)據(jù)集篩選并驗證泛癌血小板內(nèi)參基因”為主題的學術(shù)研究。文霄瑕同學主要研究方向為血小板轉(zhuǎn)錄組學的肺癌診斷研究,導師是冷平副教授。文霄瑕同學在平時的學習和科研工作中積極上進,刻苦鉆研專業(yè)知識,以第一作者發(fā)表北大核心論文1篇,參與發(fā)表SCI論文4篇,其中以第一/共一作者發(fā)表SCI論文2篇。
本次論壇中,文霄瑕就“Selection and Validation of Reference Genes for Pan-Cancer in Platelets Based on RNA-Sequence Data”這篇文章進行了詳細闡述。該文章研究目的有兩點,1)擬篩選穩(wěn)定的內(nèi)參基因,用RT-qPCR方法驗證參考基因的穩(wěn)定性;2)通過腫瘤血小板轉(zhuǎn)錄數(shù)據(jù)集挖掘候選基因,并采用驗證后的內(nèi)參基因作為內(nèi)標的RT-qPCR一致性驗證。候選基因篩選數(shù)據(jù)集來源于Best MG等在2015年公開發(fā)表的數(shù)據(jù)集GSE68086,接著闡述了該數(shù)據(jù)集中候選基因的篩選流程,并用另一個血小板測序數(shù)據(jù)集GSE89843來驗證篩選出來的7個候選基因的穩(wěn)定性,結(jié)果表明,選擇的所有7個候選基因在另一個血小板數(shù)據(jù)集(GSE89843)中也穩(wěn)定表達。作者詳細講述了臨床驗證流程以及樣本提取流程。接著在GSE68086中篩選出肺癌差異基因表達明顯且表達量高的FLNA基因作為目的基因,來驗證GAPDH的穩(wěn)定性。
通過這次研究生論壇,同學們了解了報告人文霄瑕在基于血小板測序數(shù)據(jù)集篩選和驗證多種惡性腫瘤穩(wěn)定內(nèi)參基因的主要思路,這次論壇拓寬了同學們的知識面,開闊了學術(shù)視野,有助于保持同學們科研思路的活躍性。本次論壇的成功舉辦,進一步激發(fā)了同學們的學術(shù)熱情,對提高我院研究生的培養(yǎng)質(zhì)量發(fā)揮了積極作用。
圖/文 劉珊