我校中醫(yī)藥創(chuàng)新研究院/交叉學科研究院本草基因組學團隊于2023年2月18日在《Molecular Therapy-Nucleic Acids》(中科院一區(qū),TOP期刊)在線發(fā)表了題為“Artificial Intelligence for Drug Discovery: Resources, Methods, and Applications”的文章。我校陳偉教授為第一作者和共同通訊作者,陳士林首席教授為共同通訊作者,張三印教授為共同作者。
藥物是預防或治療疾病的物質,對于保證人類健康具有重要作用。然而,一種新藥的研發(fā)通常需要近26億美元的資金投入和近14年的時間投入。因此,有必要開發(fā)新方法以降低藥物研發(fā)成本、提高藥物研發(fā)效率。高性能計算機算力的不斷增強和海量生物數(shù)據(jù)的產生,推動了人工智能技術(AI)在藥物研發(fā)領域的應用,提高了藥物發(fā)現(xiàn)效率、縮短開發(fā)進程。
該論文針對AI在藥物發(fā)現(xiàn)領域應用問題,介紹了藥物研發(fā)中廣泛使用的數(shù)據(jù)資源、AI模型可讀的分子編碼方法和常用的AI算法;論述了AI在藥物研發(fā)中的典型應用,包括預測藥物毒性、藥物從頭設計、藥物靶點結構預測、藥物-靶點相互作用預測、藥物協(xié)同/拮抗預測等;總結了AI及其新生工具ChatGPT在藥物研發(fā)中面臨的挑戰(zhàn)和解決方案。
該論文研究得到了四川省自然科學基金(2023NSFSC0683)和國家中醫(yī)藥管理局中醫(yī)藥創(chuàng)新團隊及人才支持計劃項目(ZYYCXTD-D-202209)的支持。
原文鏈接:https://doi.org/10.1016/j.omtn.2023.02.019
(供稿:中醫(yī)藥創(chuàng)新研究院/交叉學科研究院)