RNA互作網(wǎng)絡(luò)對于復(fù)雜疾病研究有著重大意義。盡管已有數(shù)據(jù)庫收錄了RNA互作信息，但伴隨測序技術(shù)逐漸完善并日趨成熟，RNA互作數(shù)據(jù)大量涌現(xiàn)。近期，成都中醫(yī)藥大學(xué)中醫(yī)藥創(chuàng)新研究院陳偉教授團(tuán)隊和南方醫(yī)科大學(xué)王棟教授團(tuán)隊在生物信息學(xué)領(lǐng)域頂級期刊Nucleic Acids Research (中科院JCR一區(qū))上發(fā)表了題為“RNAInter v4.0: RNA interactome repository with redefined confidence scoring system and improved accessibility”的論文。
論文通過對多源RNA互作數(shù)據(jù)進(jìn)行有效整合，構(gòu)建了綜合性數(shù)據(jù)資源與分析平臺RNAInter，實(shí)現(xiàn)了對不同類型RNA互作數(shù)據(jù)進(jìn)行查詢、分析和預(yù)測的功能。RNAInter數(shù)據(jù)庫是目前RNA相關(guān)互作領(lǐng)域數(shù)據(jù)量最大，涵蓋信息面最豐富的數(shù)據(jù)庫。
南方醫(yī)科大學(xué)康娟娟博士和成都中醫(yī)藥大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院博士生唐強(qiáng)為本論文共同第一作者，成都中醫(yī)藥大學(xué)中醫(yī)藥創(chuàng)新研究院陳偉教授、南方醫(yī)科大學(xué)王棟教授、蘇晞教授、黃燕教授為本論文的共同通訊作者。
該工作得到了中醫(yī)藥創(chuàng)新研究院生物信息學(xué)高性能計算平臺的算力支持。
（圖、文/中醫(yī)藥創(chuàng)新研究院 陳偉）