成都中醫(yī)藥大學(xué)建校于1956年，是新中國最早建立的四所中醫(yī)藥高等院校之一。原名成都中醫(yī)學(xué)院，1995年更名為成都中醫(yī)藥大學(xué)。歷經(jīng)60余年的建設(shè)發(fā)展，已成為一所以中醫(yī)藥學(xué)科為主體、醫(yī)藥健康相關(guān)學(xué)科專業(yè)相互支撐、協(xié)調(diào)發(fā)展的特色鮮明的高水平中醫(yī)藥大學(xué)，四川省人民政府、教育部、國家中醫(yī)藥管理局共建高校，國家新一輪“雙一流”建設(shè)高校。

建院初期，學(xué)院的文書檔案由黨委辦公室專人兼職，分類立卷；1961年起院辦確定一人專管行政和教學(xué)檔案，做了一定工作；“文革”中，檔案工作無人管理，處于癱瘓狀態(tài)；1972年底黨委成立，辦公室組織了三人整理檔案；1979年底黨辦曾舉辦一期文書檔案學(xué)習(xí)班，學(xué)習(xí)文書檔案工作的基本知識，制定一些相關(guān)的制度，這對檔案工作的正常開展起了較好的作用；1980年正式確定了專職干部一人，撥了一間50多平方米的用房作檔案室，有檔案柜20余個；1984年，學(xué)院批準(zhǔn)正式成立綜合檔案室，隸屬于學(xué)院辦公室，設(shè)專職檔案人員兩名，其中任命主任一人；1992年底綜合檔案室搬遷至現(xiàn)址，有庫房300多平方米，鐵皮柜36套，木柜22套；1992年底新增檔案專職人員1名，并將檔案室定位副處級機構(gòu)，主任為副處級干部。2006年原生殖管理學(xué)院和原衛(wèi)生干部管理學(xué)院并入成都中醫(yī)藥大學(xué)后，2007年9月11日學(xué)校成立檔案館，為正處級機構(gòu)。2022年3月學(xué)校圖書館與檔案館合署辦公。

檔案館目前有5個全宗，包括四川中醫(yī)進修學(xué)校、成都中醫(yī)學(xué)院、四川省衛(wèi)生管理干部學(xué)院（包括四川省立成都高級醫(yī)事職業(yè)學(xué)校、成都醫(yī)學(xué)專科學(xué)校、四川省衛(wèi)生干部進修學(xué)校時期）、 四川生殖衛(wèi)生學(xué)院（包括成都婦幼保健與計劃生育專門人員培訓(xùn)中心、四川省計劃生育管理干部學(xué)院、四川生殖衛(wèi)生學(xué)院）、成都中醫(yī)藥大學(xué)。現(xiàn)有館藏包含了黨群、行政、外事、教學(xué)、科研、設(shè)備、基建、會計、出版、聲像、名人等類別檔案，現(xiàn)有館藏檔案近7.5萬卷，電子文件近400萬頁。